Bir asırdan fazla bir süredir bilim insanları insan vücudundaki uçsuz bucaksız mikrobiyal dünyayı analiz ettiler. Sağlığımızı birçok yönden etkileyen bakteriler, mantarlar ve virüsler buldular. Vücudumuzda ne olduğuna dair iyi bir fikrimiz olduğunu düşünüyorduk. Ancak doğa, sıklıkla yaptığı gibi, bize bir sürpriz yapmış gibi görünüyor.
Bağırsaklarımızın ve ağzımızın mikrobiyal toplulukları içinde gizlenmiş, araştırmacılar binlerce küçük, virüs benzeri genetik varlık tanımladılar. Bunlar virüs değil, bakteri değil ve daha önce gördüğümüz hiçbir şeye benzemiyorlar. Bunlara dikilitaşlar diyorlar – yaşamın ne olduğu hakkındaki temel varsayımlara meydan okuyan yassı, çubuk şeklindeki RNA halkaları.
Bazı araştırmacılar bunu “başka bir dünyadan gelen fosillere” benzetiyor.
Dikilitaşlar Nelerdir?
Dikilitaşların keşfi genetik veri tabanlarına derinlemesine bir dalıştan geldi. Stanford Üniversitesi’nden Ivan Zheludev ve Andrew Fire liderliğindeki bir bilim insanları ekibi, insan dışkısı ve tükürük örneklerinden çıkarılan RNA dizileri koleksiyonları olan devasa metatranskriptomik veri kümelerini analiz etti . Buldukları şey şaşırtıcıydı: Kaydedilen biyolojide hiçbir şeye benzemeyen RNA çemberleri oluşturan yaklaşık 30.000 farklı dizi. O kadar sıra dışılar ki onları yaşam ağacında nereye koyacağımızı bilemiyoruz.
İşleri daha da garip kılan şey, bunların oldukça yaygın görünüyor olması. Bu yapılar dünya çapında bağırsak bakterilerinin yaklaşık %7’sinde ve ağız bakterilerinin %50’sinde tespit edilmiş olması, yaygın bir varlığa işaret ediyor.
Obeliskler bir nevi virüslere benzerler ancak virüslerden farklı olarak dış protein kaplamaları yoktur. Yapıları, basit RNA halkalarından oluşan ve protein kaplaması olmayan bitki patojenleri olan viroidleri anımsatır. Ancak obeliskler bitkilerde bulunmaz. Bunun yerine, insan ağızlarında yaygın bir mikrop olan Streptococcus sanguinis de dahil olmak üzere bakteri türlerinde yaşarlar.
Ayrıca gerçekte ne yaptıkları da belirsiz. Patojen gibi görünmüyorlar, bu yüzden sadece iyi huylu yolcular olabilirler, konakçılarını değiştirmeden bakterilerin içinde sessizce var olabilirler. Alternatif olarak, mikrobiyal genetikte aktif bir rol oynayabilir, potansiyel olarak bakteriyel davranışı etkileyebilir veya hatta insan hücreleriyle etkileşime girebilirler. Sindirim, bağışıklık veya hatta hastalıklar üzerinde önemli etkileri olabilir; ancak bilmiyoruz.
Peki… onlar hakkında neler biliyoruz?
Araştırmacılar ayrıca obelisk genomları tarafından kodlanan, geçici olarak oblinler olarak adlandırılan benzersiz proteinler tespit ettiler . Protein kodlamayan geleneksel viroidlerin aksine, bu RNA halkaları bakteri veya hatta insan hücreleriyle etkileşime girebilecek moleküller üretebiliyor gibi görünüyor. Bunun gerçekte ne anlama geldiğini söylemek zor, ancak bu proteinlerin var olması, obelisklerin ya bir viroid ile bir virüs arasında bir şey ya da tamamen yeni bir şey olduğunu gösteriyor.
Chapel Hill’deki Kuzey Carolina Üniversitesi’nde hücre ve gelişim biyoloğu olan Mark Peifer, “Bu çılgınlık,Ne kadar çok bakarsak, o kadar çılgın şeyler görüyoruz.” diyor
Bunlar evrimsel kalıntılar olabilir
yaşamın gelişimindeki eski bir aşamanın kalıntıları. Hatta virüslerin evrimsel tarihinde eksik bir halka bile olabilirler, bu da viral genomların daha karmaşık bulaşıcı etkenlere dönüşmeden önce bunlar gibi basit RNA halkaları olabileceğini düşündürmektedir.
Bu dikilitaşların canlı olup olmadığını bile bilmiyoruz. Aslında, bilim insanları virüslerin canlı olup olmadığını onlarca yıldır tartışıyorlar (çünkü bir konak hücrenin moleküllerinden bağımsız olarak çoğalamazlar). Dikilitaşlar daha da basit “yaratıklar” gibi görünüyor ve “canlı” olarak kabul ettiğimiz şeyleri yeniden gözden geçirmemize neden olabilirler.
Yine de, gizemli doğalarına rağmen, dikilitaşların tıp ve mikrobiyom araştırmaları için pratik çıkarımları olabilir. Bakteriyel popülasyonları düzenlemede rol oynuyorlarsa, iltihaplı bağırsak hastalığı, obezite veya hatta ruh sağlığı bozuklukları gibi bağırsak mikrobiyomuyla bağlantılı koşulları etkileyebilirler.
Gelecekteki araştırmaların, dikilitaşların tıbbi müdahaleyi gerektirecek şekilde insan sağlığıyla etkileşime girip girmediğini veya içimizdeki uçsuz bucaksız mikrobiyal dünyanın yalnızca başka bir gizli özelliği olup olmadıklarını araştırması gerekecektir.
Yorumlar
0 Yorumlar
